《美人鱼第二季》的故事紧接第一季，Emma、Cleo和Rikki三个女孩从Mako岛的月池获得了美人鱼力量之后，生活变得既刺激又麻烦，她们碰到水就会变身，还要想尽办法隐藏秘密，不能被送去海洋馆也不能变成科学研究的实验品。第二季一开场就是一场大麻烦，一次满月伴随着罕见的行星排列，把三个女孩召唤到了Mako岛的月池，她们的魔法力量在月光下被大幅度增强，强大到几乎失控，在水上对Lewis的船造成了不小的破坏，第二天她们才意识到不管怎么闹别扭，她们还是需要Lewis这个唯一知道她们秘密的男生帮忙。可第二季真正的风暴来自一个新来的女孩Charlotte Watsford，她搬到这片区域之后，对Lewis产生了强烈的兴趣，而Lewis当时刚被Cleo嫌弃太过粘人和过度保护，两个人正处于分手状态，Charlotte的出现正好填补了Lewis的空窗期。更巧的是，Charlotte的祖母Gracie Watsford曾经也是一条美人鱼，Charlotte看到祖母当年的影像之后找到了Max Hamilton，Max曾经和Gracie有过一段感情，他看到恋人的孙女非常开心，就把过去美人鱼的事情和Mako岛的秘密全部告诉了她。Charlotte在满月之夜独自跑到月池，水花溅起的那一刻，她成了第四条美人鱼，而且一个人就拥有了Emma、Cleo和Rikki三个人的全部能力，控水、控风、结冰、加热，样样都有。Charlotte很快就飘了，她觉得自己才是那条真正的美人鱼，三个女孩不过是意外获得力量的冒牌货，这种傲慢让她和Emma她们从暗中较劲演变成水火不容的死敌。Rikki的性格本来就暴躁，看见Charlotte在Lewis面前卖乖更是气不打一处来，Emma试图保持理智但Charlotte总是精准地踩到她的底线，Cleo夹在中间最难受，因为她对Lewis还有感情，却眼睁睁看着他和Charlotte越走越近。第二季的另一条重要线索是满月对美人鱼的异常影响，每次满月她们的力量都会不受控制地暴涨，甚至做出自己根本不想做的事情，这逼迫她们必须更小心地管理自己的秘密。高潮部分是一场异常强大的满月之夜，Charlotte和三个女孩的矛盾彻底爆发，双方在力量暴涨的情况下展开了一场美人鱼之间的对决，最终Charlotte被永久剥夺了美人鱼的力量和能力，变回了普通女孩。Charlotte的退场让Lewis看清了自己的心意，他发现自己真正在乎的还是Cleo，于是和Charlotte分手，重新回到了Cleo身边，三个女孩的生活也慢慢恢复了平衡。整部《美人鱼第二季》用第四条美人鱼、满月失控、能力争夺和感情纠缠把青春奇幻剧推向了更激烈的冲突，主角名称包括Emma Gilbert、Cleo Sertori、Rikki Chadwick、Lewis McCartney、Charlotte Watsford、Zane Bennett、Ash Dove、Max Hamilton和Gracie Watsford，而《美人鱼第二季》最精彩的地方是它让Charlotte成为了一个不讨喜但不扁平的对手，她不是纯粹的坏人，只是一个被突然获得的力量冲昏了头的女孩，而Emma、Cleo和Rikki在对付她的过程中也第一次真正意识到，美人鱼的力量不是用来证明谁更特别的，是用来保护彼此的秘密和友谊的，所以当《美人鱼第二季》最后Charlotte失去力量站在月池边时，观众才会既觉得痛快又有点替她难过。