《玛利亚狂热第二季》从宫前佳奈子升上二年级之后依然没能摆脱祇堂鞠也的魔爪开始，她本来以为新学期换宿舍就能逃离那个穿裙子的男生，结果鞠也动用理事长的关系把两个人的房间调到了一起，佳奈子站在宿舍门口，看着鞠也穿着睡衣对她微笑，她转身就想跑，鞠也一把拉住她的领子说，你去哪里，我们的同居生活才刚开始。第二季的混乱比第一季更上一层楼，祇堂鞠也的妹妹祇堂静珠突然出现在学校里，静珠和鞠也长得几乎一模一样，可她穿的是男装，性格比鞠也还要难搞，佳奈子第一次见到静珠的时候以为鞠也终于露出了真面目，结果静珠开口说我是他妹妹，佳奈子当场晕过去。汐王寺茉莉花继续用她那张毒舌把所有人怼得哑口无言，桐奈奈美和稻森弓弦的戏份也比第一季更多，宿舍里的其他女生开始怀疑鞠也的性别，佳奈子每次都要在真相和谎言之间拼命打圆场。第二季的校园活动一个接一个，文化祭上鞠也反串罗密欧，佳奈子被迫演朱丽叶，两个人在舞台上差点亲到，观众席尖叫成一片，佳奈子下台之后躲在后台哭，鞠也递给她一瓶水，说你的演技真差，佳奈子把水泼在他脸上。暑假合宿的时候，鞠也穿着女装混进女生温泉，佳奈子为了掩护他差点被老师抓住，静珠在关键时刻出现把老师引开，三个人在月光下坐在温泉边上，鞠也难得没有戏弄佳奈子，他说谢谢你，佳奈子愣住，然后说你是不是发烧了。玛利亚狂热第二季的结尾，佳奈子终于不再执着于揭穿鞠也，她接受了这个每天让她心跳加速又让她头疼欲裂的室友，鞠也站在宿舍阳台上，风吹起他的长发，他对佳奈子说，你好像终于认命了，佳奈子说我不是认命，我是懒得跟你斗了，鞠也笑了，那个笑比第一季更真。这部《玛利亚狂热第二季》把伪娘、校园祭和越来越深的羁绊绑在一起，让每一次伪装都像一次告白，观众看着佳奈子从抗拒到接受，会明白有些关系不是靠真相维持的，是靠两个人都不愿意先放手。《玛利亚狂热第二季》里出现的主要角色名称包括宫前佳奈子、祇堂鞠也、祇堂静珠、汐王寺茉莉花、桐奈奈美、稻森弓弦、石马隆显和天妃女子学院的其他学生，而《玛利亚狂热第二季》最后让佳奈子和鞠也坐在宿舍地板上吃泡面，佳奈子说下学期我一定要换宿舍，鞠也说好啊，然后把自己碗里的蛋夹给佳奈子，佳奈子看着那颗蛋，叹了口气，咬了一口。