《萝莉的时间第二季》从青木大介在新学期看见九重凛长高一点开始，他本来以为经过一年风波，孩子们会成熟，结果凛还是调皮，黑还是安静，美还是咋呼，京子还是冷静，礼子老师怀孕，校长换人，新主任严厉，林志调走，转学生小南加入，青木被安排带毕业班，压力更大，凛想引起他注意，黑偷偷写小说，美参加选秀，京子准备升学，小南不合群，青木没有偏心，他让凛当副班长，黑做板报，美管文艺，京子辅导，小南负责植物角，礼子教经验，新校长观察，林志偶尔回来看，孩子们在冲突中成长，凛学会尊重，黑学会表达，美学会接受失败，京子学会放松，小南学会融入。剧中出现的主角有青木大介、九重凛、镜黑、宇佐美美、宝院京子、礼子、新校长、林志、小南。中段最惊险的一场戏发生在毕业旅行，山间旅馆起火，凛被困，青木冲进去，黑报警，美喊人，京子组织撤离，小南引路，礼子安抚，新校长调度，林志带救援，青木背凛出来，自己受伤，凛哭，黑递水，美唱歌，京子念名单，小南拿药，家长赶到，青木康复，凛在毕业式读信，黑送画，美唱歌，京子演讲，小南送花，礼子生娃，新校长认可，林志回来合影，青木站在校门口，看他们跑远。《萝莉的时间第二季》用毕业、火灾和一场成长，把校园故事写成学会放手的告别，也让人明白第二季不是重复，是孩子们终于敢自己往前走。