《美国恐怖故事第三季》把镜头对准新奥尔良的罗比乔克斯小姐卓越女巫学校，佐伊·本森是个刚发现自己拥有致命性能力的少女，她和男友亲热时男友突然七窍流血而死，她吓得连夜逃出家门，被学校代表麦迪逊·蒙哥马利带到新奥尔良。学校里住着一群年轻女巫，奎妮能用巫术控制人体，南·奥哈拉是盲人但能看见鬼魂，米斯蒂·戴拥有复活能力却总被人当成怪物烧死，麦迪逊是过气童星，脾气比巫术还大。校长科迪莉亚·福克斯负责照顾她们，但她母亲菲奥娜·古德才是真正的至尊女巫，菲奥娜年轻、强大、自私，为了永葆青春不惜杀死任何可能取代她的女巫。菲奥娜来到学校后，第一件事就是杀死斯伯丁先生，因为斯伯丁是她的旧情人，也是学校的管家，他知道太多秘密。新奥尔良还有另一股势力，伏都教女王玛丽·拉沃，她住在沼泽里，能用血和骨头复活死人，玛丽和菲奥娜有旧仇，因为菲奥娜当年抢走了她的至尊地位。玛丽身边有德尔菲娜·拉劳里，一个从十九世纪活到现在的社交名媛，她曾经折磨和杀害无数奴隶，如今被玛丽复活，继续她的残忍游戏。佐伊在学校认识了凯尔，一个被麦迪逊用巫术复活的大学男生，凯尔原本阳光善良，复活后却因为母亲的虐待和麦迪逊的占有欲变得扭曲，佐伊一边照顾凯尔，一边发现自己的性能力其实是黑寡妇血脉，她每次和凯尔亲热都会差点杀死他。麦迪逊嫉妒佐伊，想抢走凯尔，结果被菲奥娜割喉，菲奥娜以为麦迪逊死了，可麦迪逊其实被科迪莉亚救活，只是再也唱不了歌。科迪莉亚嫁给了一个女巫猎人，丈夫发现她的身份后带人来烧学校，菲奥娜杀死猎人，科迪莉亚失明，却因此获得第二视觉，能看见过去和未来。玛丽·拉沃和菲奥娜决战，玛丽把菲奥娜困在棺材里，菲奥娜靠吸食年轻女巫的生命逃出来，反手杀死玛丽，可玛丽临死前诅咒菲奥娜会死在自己女儿手里。剧情中段，学校被女巫猎人围攻，佐伊、奎妮、南、米斯蒂和麦迪逊联手反击，南用鬼魂军队吓退猎人，米斯蒂复活被杀的姐妹，奎妮用巫术把猎人首领变成玩具，佐伊用黑寡妇能力杀死最后一个猎人。菲奥娜发现自己衰老得越来越快，她试图杀死科迪莉亚，因为科迪莉亚是下一任至尊，但科迪莉亚在佐伊和米斯蒂帮助下反杀菲奥娜，菲奥娜死前说你以为你赢了，其实你只是变成我。科迪莉亚成为新至尊，她复活了麦迪逊和米斯蒂，佐伊成为她的副手，奎妮去洛杉矶开了一家巫术美发店，南留在学校教新学生。最后科迪莉亚带着新一代女巫走进新奥尔良夜色，她说女巫不是怪物，是还没被烧死的女人。《美国恐怖故事第三季》用女巫学校、伏都教、至尊之争、复活巫术和女性觉醒把恐怖拍成一场华丽内战，主角名称包括菲奥娜·古德、科迪莉亚·福克斯、佐伊·本森、麦迪逊·蒙哥马利、奎妮、南·奥哈拉、米斯蒂·戴、玛丽·拉沃、德尔菲娜·拉劳里、斯伯丁先生、凯尔·斯宾塞、斧头人和帕帕·莱格巴，而《美国恐怖故事第三季》最动人的地方不是巫术多强，是每个女巫都在寻找自己的位置，菲奥娜用权力找，科迪莉亚用责任找，佐伊用爱找，米斯蒂用复活找，最后她们发现真正的至尊不是最强的那个，是愿意把其他女巫挡在身后的那个，所以当《美国恐怖故事第三季》结尾科迪莉亚站在学校门口时，观众才明白，女巫集会不只是恐怖故事，是一群被世界害怕的女人决定不再害怕自己。